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A injeção de pantoprazole é usada como um tratamento de curto prazo para tratar a doença do refluxo gastroesofágico (GERD; uma condição na qual o fluxo retrógrado de ácido do estômago causa azia e possível lesão do esôfago [o tubo entre a garganta e o estômago]) em pessoas que tiveram danos no esôfago e que são incapazes de tomar pantoprazole pela boca. Também é usado para tratar condições em que o estômago produz muito ácido, como a síndrome de Zollinger-Ellison (tumores no pâncreas e intestino delgado que causaram aumento da produção de ácido estomacal). Pantoprazole está em uma classe de medicamentos chamados inibidores da bomba de prótons. Funciona diminuindo a quantidade de ácido feita no estômago.
A injeção de pantoprazole vem como pó a ser misturado com líquido e dado por via intravenosa (em uma veia) por um médico ou enfermeiro em uma instalação médica. Para o tratamento de GERD, a injeção de pantoprazole é geralmente dada uma vez por dia durante 7 a 10 dias. Para o tratamento de condições em que o estômago produz muito ácido, a injeção de pantoprazole é geralmente dada a cada 8 a 12 horas.